在上海，一年一度的高新技术企业认定申报已经开始，会计师事务所也已开始承接该项专项审计业务。下面，我们就上海高新技术企业认定审计中存在的主要风险作介绍。

一、缺乏独立性
由于上海高新技术企业认定审计所涉的时间跨度长达三年之久，很多企业在财务的准备中都是临时抱佛脚，需要对以前年度的财务资料进行补充、完善。会计师事务所因其专业性为企业代理编制研发费用辅助账，同时又为企业出具专项审计报告，从而无法保持实质上和形式上的独立性，影响其客观性。
二、业务承接的风险
许多会计师事务所在承接该项业务过程中未充分评估潜在的风险，在出具审计报告时，由于使用方只接受无保留意见的审计报告，造成无法出具非无保留意见的审计报告而骑虎难下。
三、财务报表与纳税申报表中研发费用存在重大差异时可能导致的审计风险
由于企业以前年度未对研发费用进行单独核算，对此差异注册会计师在审计时应予以特别关注。
四、委托外部研发费用的审计风险
如果申报企业委托外部的研发费用占比过高，尤其是对关联企业之间的委托业务，应重点关注其活动轨迹，确保没有重大的虚构情况。
五、关注研发费用与研发项目之间的之间的相关性、合理性
有研发项目才会有研发费用的发生，首先，要收集研发项目的相关资料以确认研发项目的真实存在。其次，要关注研发费用发生额与研发项目内容之间的相关性、合理性。
六、关注产品高新收入与获取相关证书的关联性
企业主要产品拥有在技术上发挥核心支持作用的知识产权的所有权是注册会计师确认高新收入所应当获取的必要审计证据，注册会计师应重点关注知识产权证书不应晚于审计报告的日期。
以上是对上海高新技术企业认定审计中存在的主要风险的介绍。

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